註：以下為《越獄》越獄第五季第一集劇情介紹，含有劇透。如不希望看到請繞行！
自由是需要付出代價的[ | ]
劇集一開始，T-bag從監獄放出，恢復了自由。在清理物品的時候，他發現了一封信。上面是一副邁克爾在監獄的照片。這讓他非常吃驚。沒人會想到已經死去的邁克爾其實被關在某個監獄，竟然還活着。這也預示着新的故事即將展開。
林肯被兩個黑幫人追殺。由於過的非常慘澹，林肯借了黑幫頭目10萬塊錢，到處躲債。在逃開黑幫追殺之後，他回到了自己的家中，門口等待他的卻是T-bag。林肯讓他馬上離開，T-bag卻掏出了信件給林肯，告訴他其實邁克爾沒死。林肯並不相信他的話，T-bag希望拿回信件，林肯不給。Tbag說他其實早已經複印了一張，而這張照片也正是讓他們必然重逢的原因，之後就離開了。
T-bag離開後，林肯帶着照片開車去見Sara。一路神情緊張，怕有人跟蹤。到了Sara家中，Sara質問他為什麼沒有來參加自己的婚禮。林肯解釋說其實是因為自己過的慘澹，不希望讓侄子看到。之後他掏出了信件，Sara並不相信邁克爾還活着。此時邁克爾的兒子和Sara的丈夫雅克布都回到家中。
林肯走後，帶着惆悵和疑問去了邁克爾的墓地。他起初並不相信自己的弟弟還活着，卻無意中發現了信件中的玄機-一行特別的字，寫着Ogygia Prison。之後林肯查詢了這個叫做奧傑吉厄得的監獄，希望能夠找出真相。
「借你之手，你會看到子孫的榮光」[ | ]
T-bag在酒店準備招妓，卻發現了一封邀請他參與假肢醫學實驗的郵件。第二天他在晚上9點半準時赴約見到了這位假肢博士-惠特科姆博士。他正在研發一種假肢，人在穿戴上以後會通過大腦感應支配假肢，感覺和真的一樣。但是因為缺少資金支持，他接受了一筆匿名捐款。而條件之一就是必須讓T-bag作為第一個實驗對象。
此時的林肯，半夜跑去了邁克爾的墳墓，開始挖墓，希望看看邁克爾的屍體是否還在，卻發現墳墓里只有邁克爾的衣服，並沒有屍體。第二天，他在開車等紅綠燈的時候，一輛車停在他旁邊。車裡的人使用電腦操控讓林肯的車受到控制並且失去了方向，通過不斷加速衝進，試圖殺死他。
他在掉進河裡之後，也有另外一個人出現，試圖殺死他。因為路人的緣故，林肯逃過一劫。
之後林肯打電話給Sara。而也正在此時，Sara發現有個女人拿槍闖進了家裡，試圖謀殺。她一邊往樓上跑去找自己的兒子，一邊大聲沖雅克布喊叫去拿槍。雅克布打着槍走出來的時候被女子打傷，而Sara此時帶着兒子躲進了洗手間。
由於警察及時趕到，女子迅速離開了，Sara和孩子躲過一劫，雅克布被送往醫院。
林肯趕到醫院，和Sara一席談話之後，他決定去也門找出原因。
林肯找到Cnotes，希望能夠獲得他的幫助。此時的Cnotes已經皈依了清真教。他們在核實了監獄真正存在之後，打電話給監獄查詢是否有邁克爾其人，卻一無所獲。
通過在網站上通過查找弟弟的名字，他們發現也門擁有邁克爾·斯科菲爾德同名的犯人卻是另外一個人的照片，擁有一個不同的身份。他們感到有人試圖把邁克爾的記錄全部抹掉。
T-bag決定做手術。手術之後，他的假肢可以自由靈活。他逼問惠特科姆博士到底是誰進行了捐獻。博士說他並不知道，只是收到了一個詞「奧迪斯」，希臘語是「沒有人」的意思。
風暴會捲土重來[ | ]
此時，林肯在酒店遇到了蘇克雷，他從Cnotes那裡得到了關於邁克爾的消息，希望一同去也門救邁克爾。Cnotes此時也趕來機場，希望能夠一同去，因為他可以尋找清真寺的朋友幫忙。一番商量之後，Cnotes和林肯最終決定一同前往也門，卻沒想到了被人在機場跟蹤。這些人希望他們在也門被殺死。
林肯和Cnotes到達也門之後，他們誤入了一個人的車，被拉到了一個倉庫，之後他們和一群不知來歷的人開始了一番激戰。隨後，真正的接頭人希巴及時趕來，將其接走，躲過了外面暴徒的行動。
希巴幫助安排林肯和Cnotes去監獄見邁克爾。而作為回報，中間人要求取得林肯的美國護照。因為在也門政府暴亂的情況下，美國護照是最值錢的。林肯答應了他的條件。
他們在去了監獄之後，一番周折之下，終於見到了邁克爾。而此時他們也發現邁克爾改名為坎尼爾奧提斯。擁有這個名字的人其實是也門的一個謀殺犯，並且曾經試圖推翻過政府。希巴以為林肯是見此人，聽到名字之後憤然離開。
終於，他們見到了邁克爾，但是他去自稱不認識他們，並讓他們離開。林肯發現了他手中出現兩個新的紋身，紋有一雙眼睛。在邁克爾走後，他雖然讓Cnote錄下了邁克爾還活着的視頻，卻感到非常絕望...